Rånarna försvann sedan springande från platsen med pengar och kontantkort till mobiltelefoner.
De två butiksbiträdena kallade på hjälp och fördes till Södersjukhuset i Stockholm för vård. Deras skador var dock inte allvarliga, sade vakthavande polisbefälet i Handen.
Rånarna var fortfarande försvunna tidigt på måndagsmorgonen, skriver Tidningarnas Telegrambyrå, TT.
Anställda misshandlade vid rån
Två maskerade män trängde in och rånade en butik i Jordbro centrum, söder om Stockholm, vid 22.30 på söndagskvällen. Männen hotade två butiksanställda med en pistol och misshandlade dem med vapnet.